林金钟

职称:教授

电话:暂无

邮箱:linjinzhong@fudan.edu.cn

地址:复旦大学生命科学学院E301-3

个人简介

男,1979年生于江苏仪征。2001年获中国农业大学学士学位。2008年获中国科学院生物物理研究所博士学位。2008年至2011年在北京生命科学研究所从事博士后研究,师从叶克穷研究员。20112016年在美国耶鲁大学从事科学研究,师从2009年诺贝尔化学奖获得者Thomas Steitz教授。20152016年任美国霍华德休斯研究所Research Specialist2017年加入复旦大学生命科学学院,任研究员、博士生导师、遗传工程国家重点实验室PI,同时受聘为复旦大学附属中山医院研究员。2017年获“国家千人计划”青年项目支持。

 

主要研究方向 (Research Interests)

我们实验室主要使用生物化学与分子生物学以及结构生物学(高分辨率冷冻电镜、X-射线晶体学和多维核磁共振)围绕蛋白质合成机器核糖体展开以下几方面的研究。

1. 基因翻译与调控的分子机制研究。mRNA的翻译即蛋白质的合成在细胞内受到严密的调控。越来越多的证据表明肿瘤发生过程往往伴随着蛋白质合成的失调。我们希望通过以下一代测序为主的分子生物学手段来加深对真核系统mRNA翻译过程特别是翻译起始过程的理解。重点研究真核mRNA 5’端非编码区与各类翻译起始因子的相互作用,阐明这些互作对mRNA特别是众多原癌基因翻译的影响。 在对翻译起始过程深入理解的基础上,再运用结构生物学解析相关重要复合物的结构,从分子层面阐述其工作机理。

2. 靶向核糖体抗生素的工作机制和耐药性机理的研究。细菌耐药性问题正发展成为严重的社会卫生公共危机,也是临床抗感染治疗失败的一个重要原因。细菌体内核糖体是抗生素的最主要靶点,有超过一半的临床用抗生素作用于核糖体上,通过干扰蛋白质的合成来杀死细菌。我们将建立细菌核糖体的高分辨率晶体学平台,结合体外翻译系统来研究靶向核糖体抗生素的工作原理以及耐药性的产出机理。在研究成果基础上探索现有抗生素的改进以及研发新型抗生素药物。

 

获奖情况 (Awards)

2015年 纽约科学院Blavatnik青年科学家奖(http://blavatnikawards.org/honorees/profile/jinzhong-lin/
2007年 中国科学院生物物理所所长论文奖
2007年 谈家桢基金九源奖学金
1997年 谈家桢生命科学奖学金一等奖

 

代表性论文和专著

1. Yangm, Z, Lin J., Ye K. Box C/D guide RNAs recognize maximal ten bases of substrates. Proc Natl Acad Sci U S A 113, 10878–10883, 2016.

2. Zhang, C., Sun, Q., Chen, R., Chen, X., Lin, J., and Ye, K. Integrative structural analysis of the UTPB complex, an early assembly factor for eukaryotic small ribosomal subunits. Nucl. Acids Res 44, 7475–7486, 2016.

3. Gagnon, M. G.*, Lin, J.*, Steitz, T. A. Elongation Factor 4 Remodels the A-site tRNA on the Ribosome. Proc Natl Acad Sci U S A 113, 4994-4999, 2016. (*equal contribution)

4. Lin, J.*, Gagnon, M. G.*, Bulkley, D. & Steitz, T. A. Conformational Changes of Elongation Factor G on the Ribosome During tRNA Translocation. Cell 160, 219-227, 2015. (*equal contribution)

5. Gagnon, M. G.*, Lin, J.*, Bulkley, D. & Steitz, T. A. Crystal structure of elongation factor 4 bound to a clockwise ratcheted ribosome. Science 345, 684-687, 2014. (*equal contribution)

6. Zhang, C., Lin, J., Liu, W. et al. Structure of Utp21 tandem WD domain provides insight into the organization of the UTPB complex involved in ribosome synthesis. PLoS One 9, e86540, 2014.

7. Lin, J.*, Lu, J.*, Feng, Y., Sun, M. & Ye, K. An RNA-binding complex involved in ribosome biogenesis contains a protein with homology to tRNA CCA-adding enzyme. PLoS Biol 11, e1001669, 2013. (*equal contribution)

8. Liu, B., Lin, J. & Steitz, T. A. Structure of the PolIIIalpha-tauc-DNA complex suggests an atomic model of the replisome. Structure 21, 658-664, 2013.

9. Zhang, L., Lin, J. & Ye, K. Structural and functional analysis of the U3 snoRNA binding protein Rrp9. RNA 19, 701-711, 2013.

10. Eiler, D., Lin, J., Simonetti, A., Klaholz, B. P. & Steitz, T. A. Initiation factor 2 crystal structure reveals a different domain organization from eukaryotic initiation factor 5B and mechanism among translational GTPases. Proc Natl Acad Sci U S A 110, 15662-15667, 2013.

11. Yang, B., Wu, YJ., Zhu, M., Fan SB, Lin, J., Zhang, K., et al. Identification of cross-linked peptides from complex samples. Nature methods 9, 904-6, 2012.

12. Xie, Q., Wang, Y., Lin, J., Qin, Y., Wang, Y., Bu, W.. Potential key bases of ribosomal RNA to kingdom-specific spectra of antibiotic susceptibility and the possible archaeal origin of eukaryotes. PLoS one 7, e29468, 2012.

13. Lin, J., Lai, S., Jia, R. et al. Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA protein complexes. Nature 469, 559-563, 2011.

14. Lin, J., Zhou, T. & Wang, J. Solution structure of the human HSPC280 protein. Protein Sci 20, 216-223, 2011.

15. Lin, J.*, Zhang, L.*, Lai, S. & Ye, K. Structure and molecular evolution of CDGSH iron-sulfur domains. PLoS One 6, e24790, 2011. (*equal contribution)

16. Xie, Q., Lin, J., Qin, Y., Zhou, J. & Bu, W. Structural diversity of eukaryotic 18S rRNA and its impact on alignment and phylogenetic reconstruction. Protein & Cell 2, 161-170, 2011.

17. Guo, B., Lin, J. & Ye, K. Structure of the autocatalytic cysteine protease domain of potyvirus helper-component proteinase. J Biol Chem 286, 21937-21943, 2011.

18. Zhou, T., Lin, J., Feng, Y. & Wang, J. Binding of reduced nicotinamide adenine dinucleotide phosphate destabilizes the iron-sulfur clusters of human mitoNEET. Biochemistry 49, 9604-9612, 2010.

19. Ye, K., Jia, R., Lin, J. et al. Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase. Proc Natl Acad Sci U S A 106, 13808-13813, 2009.

20. Lin, J., Zhou, T., Ye, K. & Wang, J. Crystal structure of human mitoNEET reveals distinct groups of iron sulfur proteins. Proc Natl Acad Sci U S A 104, 14640-14645, 2007.

 

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