近日,我院遗传工程国家重点实验室赵冰、林鑫华团队揭示了染色质重塑(Chromatin Remodeling)决定小肠干细胞(Intestinal Stem Cell)命运的分子机制,研究成果于3月6日在线发表于《自然•通讯》(Nature Communications)。该研究整合小鼠遗传学、类器官培养和分子细胞生物学方法,首次揭示染色质重塑在哺乳动物成体干细胞命运决定与组织稳态维持中的核心作用,并阐释了染色质重塑因子Znhit1调控基因时序表达的分子机制。此项工作对全面理解成体干细胞命运决定方式具有重要意义,并为干预肠炎、结肠癌等肠上皮相关疾病提供了理论基础。
图注:染色质重塑因子Znhit1决定小肠干细胞命运
表观遗传事件在生物体性状塑造中发挥关键作用。除经典的DNA甲基化和组蛋白修饰外,核小体组分变化(如:组蛋白变异体插入)引发的染色质重塑,也是表观遗传调控基因时序表达的重要形式。已知,染色质重塑复合物SRCAP可主动介导组蛋白变异体H2A.Z对核小体中H2A的替换,但染色质重塑如何调控哺乳动物成体干细胞命运决定与组织稳态并不清楚。
赵冰、林鑫华团队长期以小鼠和果蝇为模式动物,探究成体干细胞命运决定机制。本项工作源于在果蝇中肠干细胞中进行的全基因组遗传筛选,研究者构建了染色质重塑复合物SRCAP关键亚基Znhit1的条件敲除小鼠,并证实Znhit1对小肠干细胞出生后建立和维持是必须的。机制上,Znhit1通过介导H2A.Z在命运决定关键基因(Lgr5, Tgfb1, Tgfbr2等)转录起始位点的插入,发挥转录调控作用,支持小肠干细胞干性。进一步机制探索发现,Znhit1对SRCAP复合体正常运转至关重要,其能够维持H2A.Z与其伴侣亚基YL1的结合。
复旦大学生命科学学院赵冰研究员、陈颖博士和姜宁博士为本文共同第一作者,赵冰研究员和林鑫华教授为本文共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金和上海市启明星计划的资助。
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-019-09060-w