王永明/王红艳团队开发出新的小型CRISPR/Cas9工具

      SpCas9是最常用的基因编辑工具，具有活性高、编辑范围大的优点（识别NGG PAM）【1】。但是SpCas9比较大，不能被包装到AAV病毒中用于基因治疗【2】。随后科研人员开发出了几个小型CRISPR/Cas9工具，能够被包装到AAV病毒中。其中SaCas9活性较高，但是编辑范围小（识别NNGRRT PAM）【3】。其它几个小型CRISPR/Cas9活性偏低。

      2020年3月31日，复旦大学王永明课题组联合复旦大学王红艳课题组在PLOS Biology上在线发表了题为“A compact Cas9 ortholog from staphylococcus auricularis (SauriCas9) expands the DNA targeting scope”的研究论文。研究者开发出了一个新的小型CRISPR/Cas9工具，具有活性高（和SaCas9相当）、编辑范围大的优点。该Cas9来源于耳氏葡萄球菌（Staphylococcus auricularis），被命名为SauriCas9，识别NNGG PAM序列，编辑范围与常用的SpCas9一样。

图1. SauriCas9的PAM及其活性比分析

       SauriCas9通过AAV病毒包装后，在多种细胞类型中实现了基因编辑（图2），说明SauriCas9具有用于基因治疗的潜力。

图2. 利用AAV病毒递送后SauriCas9的编辑效率

      此外，研究者还把SauriCas9与脱氨酶融合，制作了两种新的碱基编辑器，本别是SauriBE4max和SauriABEmax，可以实现C-T或者A-G两种碱基转换（图3）。

图3. SauriCas9用于碱基编辑

      胡子英博士是论文第一作者，王永明研究员是论文的通讯作者。

原文链接：https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000686

参考文献：

1. Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E. A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science. 2012;337(6096):816-21.
2. Wu Z, Yang H, Colosi P. Effect of genome size on AAV vector packaging. Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy. 2010;18(1):80-6.
3. Ran FA, Cong L, Yan WX, Scott DA, Gootenberg JS, Kriz AJ, et al. In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9. Nature. 2015;520(7546):186-91.