黄强

发布者:王诗铭发布时间:2021-06-27浏览次数:478

教师基本信息

   姓名:黄强

   职称:教授

   职务:教师

   电子邮箱:huangqiang@fudan.edu.cn

   办公地点:G607

   办公电话:021-31246589


研究方向

   蛋白质和核酸药物分子工程、基因编辑系统新技术、人工智能生物技术。


个人简介

1991年本科毕业于浙江大学化学系,获学士学位(化学专业)。分别于19941998年在浙大获硕士、博士学位(物理化学专业)1999-2000年在柏林洪堡大学生物系分子生物物理专业从事博士后研究。2001-2003年间又两次回到该系及到台湾中山大学化学系继续研究工作。200412月进入复旦大学生命科学学院工作,2005年起历任副教授、教授。

黄强课题组长期从事蛋白质结构与相互作用的理论建模、计算模拟和分子设计等工作,近年致力于开展计算与实验紧密结合的基因工程前沿研究:基因工程药物的分子设计与优化、基因编辑系统的结构化学机理及分子工程、人工智能生物技术等。已在 J. Am. Chem. Soc.Nature Commun.等知名学术刊物发表SCI论文近70篇,获得授权发明专利多项,曾获得第五届中国技术市场协会金桥奖 (2011年度;第二完成人)上海市科技发明奖二等奖 (2012年度;第三完成人) , 教育部技术发明奖二等奖 (2012年度;第三完成人)


授课情况

生物技术专业课《物理化学》、专业选修课《计算结构生物学》。


招生专业

遗传学、生物信息学


代表性论文和论著

1. H. Zhu#; W. Du#, M. Song; Q. Liu, A. Herrmann, Q. Huang*. Spontaneous binding of potential COVID-19 drugs (Camostat and Nafamostat) to human serine protease TMPRSS2, Computational and Structural Biotechnology Journal. 19:467-476 (2021).

2. R. Yao, J. Qian, Q. Huang*. Deep-learning with synthetic data enables automated picking of cryo-EM particle images of biological macromolecules. Bioinformatics.36:1252-1259 (2020).

3. M. Song#, G. Li#; Q. Zhang#, J. Liu*, Q. Huang*. De novo post-SELEX optimization of a G-quadruplex DNA aptamer binding to marine toxin gonyautoxin 1/4, Computational and Structural Biotechnology Journal. 18:3425-3433 (2020).

4. Q. Liu, A. Herrmann, Q. Huang*. Surface binding energy landscapes affect phosphodiesterase isoform-specific inhibitor selectivity. Computational and Structural Biotechnology Journal. 17:101-109 (2019).

5. C. Huai, G. Li, R. Yao, Y. Zhang, M. Cao, L. Kong, C. Jia, H. Yuan, H. Chen, D. Lu*, Q. Huang*. Structural insights into DNA cleavage activation of CRISPR-Cas9 system. Nature Communications. 8:1375 (2017).

6. J. Zhu, Q. Yang, D. Dai, Q. Huang*. X-ray crystal structure of phosphodiesterase 2 in complex with a highly selective, nanomolar inhibitor reveals a binding-induced pocket important for selectivity.Journal of the American Chemical Society. 135: 11708-11711 (2013).

7. Q. Huang*, A. Herrmann. Calculating pH-dependent free energy of proteins by using Monte Carlo protonation probabilities of ionizable residues. Protein & Cell. 3:230-238(2012).

8. C. You#, Q. Huang#, H. Xue, Y. Xu, H. Lu. Hydrophobic interaction between two cysteines in interior hydrophobic region of protein improves thermostability of a family 11 xylanase from Neocallimastix patriciarum. Biotechnology and Bioengineering. 105: 861-870 (2010). (# contributed equally)

9. Q. Huang, C.- L. Chen, A. Herrmann. Bilayer conformation of fusion peptide of influenza virus hemagglutinin: a molecular dynamics simulation study. Biophysical Journal. 87:14-22 (2004).

10. Q. Huang, R. Opitz, E.-W. Knapp, A. Herrmann. Protonation and stability of the globular domain of influenza virus hemagglutinin. BiophysicalJournal.82:1050-1058 (2002).