基本信息
张经纬，青年研究员
通讯地址 Office Address：复旦大学生命科学学院
电子邮件 Email：jingwei_zhang@fudan.edu.cn
所在系所：遗传系
个人简介
2005 – 2010 清华大学（化学工程系）、香港大学（生物化学系）
美国加州大学洛杉矶分校（化学及生物化学系）
美国加州大学伯克利分校 学士（化学学院 化学生物学）
2010 – 2015
美国加州大学伯克利分校、旧金山分校联合培养 博士
（工程学院 生物工程系）
2016 – 2018 MioKun Biotechnologies Inc. CEO
2018 – 至今 复旦大学 生命科学学院，青年研究员
技术转化
2012 – 2013 加州大学伯克利分校 哈斯商学院，技术管理证书
2012 – 2015 劳伦斯国家实验室技术转让中心、创新与合作中心
产业化基金、 生物技术专利产业化评审
2016 – 2018 MioKun Biotechnologies Inc. 液滴微流控技术开发、产业化
2019 – 至今 南京普济生物有限公司 数字PCR 创始合伙人
2020 – 至今 上海高探生物科技有限公司 单细胞分析 创始人、首席科学家
教授课程 Teaching |
秋季学期：《微生物分子遗传与代谢》、《基因检测技术》、《生物技术产业与大学生生涯发展》
春季学期：《专业外语》
Research Interest |
1）基于液滴微流控的生物应用、医学诊断开发
2）高通量生物学，包括高通量单细胞测序、单细胞分析，高通量生物化学反应
科研项目 Research Projects |
1. 2023 年度科技创新行动计划，细胞与基因治疗专项项目，23J21901100，联合外壳蛋⽩VP2优化及免疫调节性纳⽶制剂技术实现AAV载体重复给药2023-12至2026-11，150万元，在研，项目高级研究员，微流控部分技术支持
2. 国家自然科学基金委员会，面上项目，32070948，新型冠状病毒的T细胞免疫表位及特异性T细胞免疫应答机制研究2019-10至2021-09，58万元，在研，项目主持；
3. 复旦大学，新型冠状病毒肺炎防治研究专项，便携式掌上新型冠状病毒肺炎诊断系统2020-06至2021-06，50万元, 结题, 主持
4. 横向课题，针对DNA编码微球的工艺开发，2021-03至2022-12，60万元，结题，主持
5. 科技部，国家重点研发计划（发育编程及其代谢调节），2020YFA0803800，运动对发育和稳态的影响2020-12至2025-11，2428万元，在研，课题组骨干；
6. 国家自然科学基金委员会，重大研究计划，集成项目（组织器官区域免疫特性与疾病），9194230029，肝细胞癌发生及进展中免疫微环境单细胞水平多组分的时空分析2020-01至2022-12，250万元, 结题, 主要参与者；
7. 上海市科学技术委员会，上海市浦江人才计划，19PJ1401600，基于颗粒模板乳化的新型单细胞测序系统的构建，2019-10至2021-09，30万元，结题，项目主持。
8. 复旦大学人才引进项目，100万元，结题，主持
论文发表 Publications |
发表 时间 | 论著（论文）名称 | 发表载体 | 论著（论文）作者 |
2024 | Harnessing HetHydrogel: A Universal Platform to Dropletize Single-Cell Multiomics | Small Methods | Guoqiang Zhou, Ting Li, Jingjing Du, Mengying Wu, Deng Lin, Weilin Pu, Jingwei Zhang*, and Zhenglong Gu* 并列通讯（封面文章） |
被Wiley系列期刊Advanced Materials Technologies作为Hot topic (Microfluidics)报道 复旦大学校友会光华生命健康分会：单细胞多组学分析！Small Methods封面｜复旦大学顾正龙/张经纬：合作开发通用型单细胞多组学分析平台 粤港澳大湾区精准医学研究院：科研进展丨顾正龙/张经纬团队合作开发通用型单细胞多组学分析平台 | |||
2023 | Exceeding 80% Efficiency of Single-Bead Encapsulation in Microdroplets through Hydrogel Coating-Assisted Close-Packed Ordering | Analytical Chemistry | Long Chen, Yi Zhao, Jie Li, Chenwei Xiong, Yi Xu, Chengren Tang, Rong Zhang, Jingwei Zhang*, Xianqiang Mi*, Yifan Liu* 并列通讯（Supplementary Cover） |
2023 | Single-cell transcriptomic analysis deciphers key transitional signatures associated with oncogenic evolution in human intramucosal oesophageal squamous cell carcinoma | Clinical and Translational Medicine | Liu, Xin-Yang；Liu, Yan-Bo；Xu, Jia-Cheng；Zhang, Yi-Fei；Ruan, Yuan-Yuan；Zhao, Yi；Wu, Lin-Feng；Hu, Jian-Wei；Zhang, Zhen；He, Meng-Jiang；Chen, Tian-Yin；Xu, Xiao-Yue；Zhang, Jing-Wei；Zhang, Yi-Qun；Zhou, Ping-Hong |
2022 | Systematic, antigen-agnostic discovery of tumor-reactive TCRs powered by repertoire-scale TCR gene synthesis and the use of banked allogeneic cancer cell lines | Journal for ImmunoTherapy of Cancer | Chen, Xi；Zhao, Yue；Porter, Ely；Cook, Danielle；Xuan, Jiekun；Huang, Xiao-Wu；Li, Bin；Zhang, Jingwei；Ren, Lili；Wei, Teng；Li, Ning |
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2022 | Permeability-Engineered Compartmentalization Enables In VitroReconstitution of Sustained Synthetic Biology Systems | Advanced Science | Luyao Li, Rong Zhang, Xintong Tian, Ting Li, Bingchun Pu, Conghui Ma, Fang Ba, Chenwei Xiong, Yunfeng Shi, Jian Li*, Jay Keasling, Jingwei Zhang*, Yifan Liu* 并列通讯（封底文章） |
AdancedScienceNews新闻报道、BioArtMED新闻报道、MEMS新闻报道、高分子科技新闻报道、微流控新闻报道 | |||
2020 | Navigating the Pandemic Response Life Cycle: Molecular Diagnostics and Immunoassays in the Context of COVID-19 Management | IEEE Reviews in Biomedical Engineering | Jingwei Zhang*, Baback Gharizadeh, Daru Lu, Junqiu Yue, Mingxia Yu, Yue Liu, Meiying Zhou通讯 |
2019 | Hydrogel Microparticles Functionalized with Engineered Escherichia coli as Living Lactam Biosensors | Sensors | Conghui Ma, Jie Li, Boyin Zhang, Chenxi Liu, Jingwei Zhang*, and Yifan Liu# 并列通讯 |
2017 | Development of a Transcription Factor - Based Lactam Biosensor | ACS Synthetic Biology | Jingwei Zhang, Jesus F. Barajas, Mehmet Burdu, Thomas L. Ruegg, Bryton Dias, and Jay D. Keasling |
2017 | Application of an acyl-CoA ligase from Streptomyces aizunensis for lactam biosynthesis | ACS Synthetic Biology | Jingwei Zhang, Jesus F. Barajas, Mehmet Burdu, George Wang, Edward E. Baidoo and Jay D. Keasling |
2015 | Metabolic engineering of Escherichia coli for the biosynthesis of 2-pyrrolidone | Metabolic Engineering Communications | Jingwei Zhang, Emily Kao, George Wang, Edward E.K. Baidoo, Matthew Chen and Jay. D.Keasling |
专利与发明 Patents & Inventions |
1. 一种水凝胶及其应用；2023115270892
提供了一种嵌入生物材料的水凝胶，其包括嵌入有生物材料的内核凝胶材料，且生物材料是经过了通透化处理的生物材料。将生物分子包裹在水凝胶中，在此水凝胶中进行通透化处理，可增加生物分子通透化的强度及各种生物反应兼容性。
2. 嵌入有生物材料的水凝胶的应用；2023115270712
提供了一种针对嵌入有生物材料的水凝胶中的生物材料进行单细胞文库构建的方法，可以用于对线粒体 DNA 进行文库构建和/或对染色质开放区间进行文库构建和/或对 3' 端转录组（RNA）进行文库构建。
3. 样本处理系统及其制备方法；2023107327831（PCT/CN2023/101043）
4. 基于拓扑捕获的RNA样本处理系统；202210694486.8（PCT/CN2023/101050）
5. 一种打破泊松分布规律形成反应隔室群的方法；202111418833.6
增加液滴对细胞与微球共捕获率，解决 “双泊松分布”造成的低效性。
6. 一种靶向反应复合物、由它形成的反应隔室以及它们的用途；202111418931.X
主要在实现对多个种类细胞进行高通量分析时,解决了单细胞与分析试剂的一对一配对问题；由于分析试剂兼具细胞识别的功能，该方法相较传统流式分选及单细胞分析方法，简化了多个种类细胞高通量分析的流程。
发明专利已授权
7. A Host Cell Modified to Produce 2-Pyrrolidone；US15/099,488
该发明涉及生物再生性尼龙高分子单体的菌种开发与发酵，2-吡咯烷酮菌种及生产工艺与中粮集团达成中试合作。
8. A Host Cell Modified to Produce Lactam
该发明首次实现己内酰胺（尼龙的单体）的生物合成通路，为生物基己内酰胺的生产奠定基础。
9. Hybrid Polyketide Synthases Application US15/144,727
发明专利Hybrid Polyketide Synthases已授权
技术转化 Technology Transfer |
1. 南京普济生物有限公司，联合创始人，基于超多重数字PCR的临床诊断相关成果为2023年基因技术教育部工程中心标志性成果；普济生物获祥峰投资和时节创投投资近亿元融资（具体额度未披露）；
2. 上海高探生物科技有限公司，联合创始人，单细胞分析；高探生物获高瓴创投天使轮融资几千万元（具体额度未披露）；