2026年1月16日，复旦大学王轲团队联合泰国那黎宣大学Wibhu Kutanan团队等在Nature子刊《Communications Biology》合作发表题为“Exploring the genomic population structure and history of Austroasiatic speakers in Mainland Southeast Asia”研究论文。本研究产出并整合东亚与东南亚地区古今多语族人群全基因组数据，系统解析了东南亚大陆自史前时期以来，人群遗传连续性与多向基因流协同塑造该地区群体遗传结构的动态过程，溯源不同语支现代人群的形成时间。
东南亚大陆，位于南亚与东亚文明的交汇地带，自古以来便是人类迁徙与文化交流的“大熔炉”，汇聚了南亚、壮侗、汉藏、南岛及苗瑶五大语系。南亚语系是迄今被认为东南亚大陆上最为古老的语言。研究用确凿的遗传学证据揭示来自东亚地区汉王朝以来的人群基因流对于东南亚铁器时代人群与南亚语系內北孟-高棉语支现代人群的关键遗传影响；即北孟–高棉语支人群或继承自东南亚铁器时代人群而东孟–高棉语支人群或继承自东南亚新石器时代人群。这些基因交流塑造了南亚语系人群遗传结构与地理分布及语言分支之间的多重对应模式，既存在高度一致的对齐关系，也存在伴随交流或隔离而产生的差异模式。这些发现为理解史前至历史时期人群连续性与多方向基因流共同作用的机制提供了新的研究视角。
研究团队新报告了东南亚大陆南部七个南亚语系与两个汉藏语系人群的全基因组数据，并结合已知数据构建了目前规模最大的南亚语系遗传数据集。聚类分析显示，南亚语系人群的遗传结构具有高度异质性，且与语言分支、地理环境具有一定关联。其中，南部低地的东孟–高棉语支与南孟语支遗传结构相近，而在北孟–高棉语支内部，不同人群间仍存在明显的遗传差异。通过遗传同源片段分析，研究发现长期隔离与跨语系基因交流共同塑造南亚语系人群的遗传异质性。
进一步分析揭示来自东亚与南亚的不同基因流构成南北部南亚语系人群遗传结构的主要差异：南部语支人群额外受南亚基因流影响，混合发生于距今约800–1200年前，这与陀罗钵地王国及高棉帝国的兴盛期吻合；北部语支人群则距今约 200–2000年之间受到不同程度东亚基因流混入，反映了汉代以来东亚人群南迁的影响，以及当地人群之间近期的基因交流。
当展开古今基因组联合分析后，研究发现南亚语系不同语支的现代人群或分别形成于不同时期，即现代人群的遗传结构形成可追溯至不同时期的古代人群。其中包括，南部低地现代人群与东南亚新石器时期个体遗传关系相近；而北部高地人群与铁器时期及历史时期个体则更为相近。值得注意的是，部分新石器时代个体在遗传学上可视为现代南亚语系东孟–高棉语支人群的单一祖先，进一步支持南亚语系作为东南亚大陆最早语言体系的语言学假设。
而东南亚本地新时代早期人群主要由本地和平文化祖先与东亚祖先混合而成。同时，研究在距今 4000多年的东南亚大陆新石器时期个体中检测到南亚相关祖先成分，表明东南亚大陆与南亚的人群交流至少可追溯至新石器时代晚期，远早于传统认知的历史时期文化接触。需要强调的是，这种南亚相关祖先成分并非对应特定的已知人群，而更可能反映了一个在亚洲早期分化并广泛分布的深层人群谱系。
本研究复旦大学为第一完成单位，由复旦大学生命科学学院的王轲研究员为最后通讯、泰国那黎宣大学的 Wibhu Kutanan教授以及瑞士苏黎世大学的 Dang Liu博士为该论文的共同通讯作者共同完成。美国科学院院士/法国里昂大学Mark Stoneking教授对本项工作给予了大力支持。复旦大学生命科学学院的王轲团队的殷姿为该论文第一作者。该项研究得到了国家自然科学基金、上海市青年科技启明星计划以及“111计划”等项目的资助。
论文信息：Yin, Z., Gupta, Y.M., Prakhun, N. et al. Exploring the genomic population structure and history of Austroasiatic speakers in Mainland Southeast Asia. Commun Biol (2026).
论文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-025-09471-0