当前，新冠病毒奥密克戎（Omicron）变异株已在全世界大范围流行，世卫组织从一开始就将其列为受关注的变异株（VOC）。该变异株后来又被划分为四个亚谱系，分别命名为：BA.1，BA.1.1，BA.2和BA.3。最初的Omicron（BA.1）于2021年11月在博茨瓦纳和南非首次被发现，又与其衍生变异株BA.1.1（含有额外的S蛋白R346K突变）一起在几周内成为全球替代德尔塔（Delta）的主导流行株。随后，亚谱系BA.2的迅速传播，成为全球的主要变体。复杂又高频的病毒突变会给现有的疫苗效用带来巨大挑战。因此，迫切需要比较所有主要Omicron亚谱系对现有疫苗引发或单克隆抗体（mAb）介导的中和的敏感性。
2022年5月8日，Cell Host & Microbe在线发表了复旦大学生命科学院王鹏飞、张文宏以及胡子欣团队题为：Antibody Evasion of SARS-CoV-2 Omicron BA.1, BA.1.1, BA.2 and BA.3 Sub-lineages的研究论文。该研究使用基于VSV的假病毒研究发现接种两剂灭活疫苗（BBIBP-CorV）的个体血清对于Omicron，显示出非常弱或几乎没有中和活性，而同源的灭活疫苗加强针或蛋白亚单位疫苗（ZF2001）的异源加强针则能显著改善针对所有Omicron变体的中和滴度。研究进一步评估了20个单克隆抗体的中和情况，其中包括10个已经授权或批准的。大多数单克隆抗体在Omicron亚谱系中完全或基本上失去了中和活性，仅个别单克隆抗体仍保留较好的中和效果。综上所述，所有四个Omicron亚谱系都威胁到当前疫苗和抗体疗法的有效性，突出了推广疫苗加强针对抗新冠新变体的重要性。
研究者之前就报道过康复者或BBIBP-CorV疫苗接种血清对BA.1的中和活性显著降低（Wang X et al. Emerg Microbes Infect. 2022）。在这里，研究者指出这些多克隆血清对其他Omicron亚谱系的中和活性下降幅度与BA.1相当甚至更大，表明所有这些亚谱系与WT病毒具有非常远的抗原距离。研究者认为BA.2相对于BA.1的选择性优势应该主要归因于其更高的传播性而不是免疫逃避。另一方面，研究者指出接种同源灭活疫苗加强针或异源蛋白质亚单位疫苗加强针可以显著提高Omicron的中和滴度。最近报道的一些新冠重组毒株（XD，XE和XF），因为它们的S蛋白与BA.1或BA.2相同，它们的抗体逃避应该与这里研究的Omicron亚谱系类似。因此，推广疫苗加强针注射仍然是预防新冠病毒传播的有效手段。
本项研究还通过单克隆抗体（mAbs）研究了Omicron亚谱系的免疫逃逸能力。与研究者对BA.1的报告类似，大多数mAbs对BA.1.1、BA.2和BA.3的中和活性完全或大幅度丧失。但研究者也观察到某些mAbs对于这些病毒呈现出不同的中和模式。例如，S309和5-7，是两个之前报道对BA.1基本保持活性的mAbs，但它们的活性被BA.2进一步逃逸。而另一些mAbs如COV2-2130和2-7对BA.1完全失去了活性，但对BA.2又恢复了活性。好消息是LY-CoV1404或bebtelovimab对所有Omicron亚系和其他主要的病毒变体都保持有效的中和活性。研究人员还构建了所以这些病毒携带的单点突变和某些突变组合，并全面地评价了20种mAbs对这些突变的中和能力研究，绘制了一张详细的抗体中和图谱。研究指出，尽管LY-CoV1404目前仍然是治疗性抗体的希望，但鉴于RNA病毒的易突变特性，如果将其作为单一疗法长期施用，仍可能会出现耐药性。因此，作者倡议开发更高效、广泛的中和抗体混合使用，以对抗不断变异的病毒。
华山医院艾静文，复旦大学王勋、何欣怡、赵晓宇，华山医院张怡以及拜盖特生物姜钰超为论文的共同第一作者，复旦大学生命科学学院以及上海市重大传染病和生物安全研究院双聘PI王鹏飞、张文宏以及复旦大学现代人类学教育部重点实验室和复旦大学人工智能创新与产业研究院胡子欣为论文的共同通讯作者。
复旦大学生命科学学院以及上海市重大传染病和生物安全研究院双聘PI王鹏飞，长期致力于艾滋病、新冠等传染病的防治研究。相关成果以第一/通讯作者身份已发表在Nature（三篇）, Cell Host & Microbe, PNAS, Nucleic Acids Research等众多国际学术期刊，更多个人信息详见: https://life.fudan.edu.cn/e5/6d/c28175a386413/page.htm。现因课题需要，面向海内外公开招聘博士后2名，另外课题组常年接收硕博研究生和本科生，欢迎有志向的青年才俊加入。
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